科學理論體系建立的關鍵不僅在于研究什么，而且在于怎樣研究。物流過程是經濟社會系統(tǒng)中的有機組成部分。它客觀上具有多樣化的外部聯(lián)系、多層次的內部結構、精巧的運行機制和靈敏的傳導機制，存在著一系列運動發(fā)展的客觀規(guī)律和趨勢，對微觀經濟實體和宏觀經濟管理有著不同的客觀要求。要認識和把握如此復雜的經濟過程，不能僅僅依靠某一種方法，而必須依靠一整套科學方法，或一個方法論體系。物流管理研究的方法，是在馬克思辯證唯物主義和歷史唯物主義的指導下，運用綜合職能研究和系統(tǒng)分析的方法。迄今為止，研究流通現(xiàn)象的方法大體上可分為三種類型:

(1)商品劃分法。它以特定商品作為研究對象來論述和分析流通問題，然后再將整個流通理論化。例如，以生產資料流通和以生活資料流通為研究對象建立起來的物資經濟學和商業(yè)經濟學，應用的就是這種方法。這種方法把流通研究視為某一部門的經濟學，雖然能使具體研究成為可能，但往往跳不出政府行政管理部門的職能范圍，這就極大地限制了考察問題的眼界，難以揭示出全社會范圍內的各種商品流通過程的共有規(guī)律性。

(2)體制劃分法。它按照構成流通的社會結構的體制，即批發(fā)業(yè)、零售、運輸、倉儲等，以此進行說明和分析，并以其為主線，建立流通理論體系。這種方法可以說很具體，但不易得出一般結論。

(3)職能研究法。它是選出與全部商品和全部體制有關的職能進行分析，并將整個流通的結構理論化。這種方法是實現(xiàn)邏輯體系化的基本方法。

綜合職能研究法的目的是要建立起這樣幾個方法的邏輯體系:①宏觀經濟環(huán)境與物流系統(tǒng)相互作用的結構，其中包括物流的產生與發(fā)展、市場經濟運行與物流系統(tǒng)等;②物流系統(tǒng)中各個職能要素相互之間的關聯(lián)結構，例如，物流過程的各項物流活動、生產物流、供應物流、銷售物流、綠色物流等;③物流管理與效率、效益、經濟發(fā)展之間的因果關系結構，如物流組織管理、費用管理、現(xiàn)代化管理和物流合理化數(shù)量分析，以及城市物流管理、國際物流管理等?！?

綜合職能研究以物流專門職能為研究的重點，同時又不忽視它們之間以及與整體的關系，否則就會出現(xiàn)簡單化，或使理論體系出現(xiàn)邏輯上的混亂。

在運用綜合職能研究方法的同時，現(xiàn)代物流管理研究還要運用系統(tǒng)分析方法。系統(tǒng)分析方法是根據(jù)客觀事物具有的系統(tǒng)特征，從分析事物整體狀況出發(fā)，著眼于整體與部分、整體與層次、整體與結構、整體與環(huán)境的相互聯(lián)系和相互作用，求得優(yōu)化的整體目標效應的綜合方法。

除了綜合職能研究方法和系統(tǒng)分析方法，現(xiàn)代物流管理研究還要綜合運用科學抽象法、靜態(tài)一動態(tài)分析法和定性一定量分析法等。只有這樣，才能從根本上改變傳統(tǒng)流通研究所存在的抽象力不足、概括能力差的現(xiàn)象，才能克服以孤立的靜態(tài)、定性分析為主，把復雜的流通過程理想化的片面性。

我國正在沿著黨所制定的路線，把建設有中國特色的社會主義事業(yè)全面推向21世紀。在這個過程中，物流的重要性將越來越為更多的人們所認識。為此，我們要借鑒發(fā)達國家的經驗，在經濟成長過程中盡早解決物流問題。只要我們以馬克思主義為指導，運用科學的方法，對物流機能進行統(tǒng)籌規(guī)劃、全面安排，推行整個經濟社會物流合理化，就一定能為我國社會主義事業(yè)的全面發(fā)展創(chuàng)造有利條件。